Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms