Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Sgo1Q9CXH7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sgo1Q9CXH7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Sgo1Q9CXH7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Sgo1Q9CXH7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sgo1Q9CXH7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Sgo1Q9CXH7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sgo1Q9CXH7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sgo1Q9CXH7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sgo1Q9CXH7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sgo1Q9CXH7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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