Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sugt1Q9CX34 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sugt1Q9CX34 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sugt1Q9CX34 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sugt1Q9CX34 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sugt1Q9CX34 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sugt1Q9CX34 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sugt1Q9CX34 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sugt1Q9CX34 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sugt1Q9CX34 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sugt1Q9CX34 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms