Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms