Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkrip1Q9CWV6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms