Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CWU4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CWU4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9CWU4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CWU4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CWU4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CWU4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms