Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm26657Q9CVR1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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Gm26657Q9CVR1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm26657Q9CVR1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms