Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atxn3Q9CVD2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atxn3Q9CVD2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms