Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930524J08RikQ9CUJ5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms