Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rhobtb3Q9CTN4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhobtb3Q9CTN4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms