Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gdpd1Q9CRY7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gdpd1Q9CRY7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gdpd1Q9CRY7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gdpd1Q9CRY7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gdpd1Q9CRY7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Gdpd1Q9CRY7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdpd1Q9CRY7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Gdpd1Q9CRY7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms