Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CRC3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CRC3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CRC3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CRC3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CRC3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRC3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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