Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5sQ9CRA7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms