Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR22

Tmem42, Transmembrane protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem42Q9CR22 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem42Q9CR22 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem42Q9CR22 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms