Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PsenenQ9CQR7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PsenenQ9CQR7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PsenenQ9CQR7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PsenenQ9CQR7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PsenenQ9CQR7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms