Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim8Q9CQQ0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim8Q9CQQ0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms