Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rwdd1Q9CQK7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rwdd1Q9CQK7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms