Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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