Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQF4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQF4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQF4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQF4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms