Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trappc5Q9CQA1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms