Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NepnQ9CQ76 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NepnQ9CQ76 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms