Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4921530L21RikQ9CQ47 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4921530L21RikQ9CQ47 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4921530L21RikQ9CQ47 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4921530L21RikQ9CQ47 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4921530L21RikQ9CQ47 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4921530L21RikQ9CQ47 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4921530L21RikQ9CQ47 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms