Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
StambpQ9CQ26 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
StambpQ9CQ26 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
StambpQ9CQ26 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
StambpQ9CQ26 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
StambpQ9CQ26 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
StambpQ9CQ26 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
StambpQ9CQ26 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms