Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc198Q9CPZ1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms