Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPN7

1810009J06Rik, RIKEN cDNA 1810009J06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810009J06RikQ9CPN7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1810009J06RikQ9CPN7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1810009J06RikQ9CPN7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms