Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms