Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf2a1Q99PM3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf2a1Q99PM3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms