Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bco2Q99NF1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms