Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Rims1Q99NE5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rims1Q99NE5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms