Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b1Q99NB9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sf3b1Q99NB9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms