Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubqln4Q99NB8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ubqln4Q99NB8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ubqln4Q99NB8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ubqln4Q99NB8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ubqln4Q99NB8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ubqln4Q99NB8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ubqln4Q99NB8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ubqln4Q99NB8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ubqln4Q99NB8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubqln4Q99NB8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms