Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcgf6Q99NA9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcgf6Q99NA9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms