Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ms4a6cQ99N08 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ms4a6cQ99N08 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ms4a6cQ99N08 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ms4a6cQ99N08 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ms4a6cQ99N08 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ms4a6cQ99N08 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ms4a6cQ99N08 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ms4a6cQ99N08 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ms4a6cQ99N08 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ms4a6cQ99N08 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ms4a6cQ99N08 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ms4a6cQ99N08 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ms4a6cQ99N08 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ms4a6cQ99N08 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms