Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nkd1Q99MH6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkd1Q99MH6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms