Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprtQ99M80 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprtQ99M80 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprtQ99M80 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
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