Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chmp1b1Q99LU0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms