Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rcbtb2Q99LJ7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rcbtb2Q99LJ7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms