Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp16Q99LG0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms