Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms