Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lims1Q99JW4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lims1Q99JW4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms