Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krcc1Q99JT5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Krcc1Q99JT5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms