Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pacsin3Q99JB8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms