Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctu1Q99J10 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctu1Q99J10 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms