Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim7Q923T7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim7Q923T7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms