Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Clip1Q922J3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Clip1Q922J3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clip1Q922J3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms