Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb6Q922F4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms