Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp4Q921I6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms