Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx18Q91ZR2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms