Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Pde6cQ91ZQ1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde6cQ91ZQ1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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