Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Basp1Q91XV3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Basp1Q91XV3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms